Annuaire du Collège de France 2016-2017
Biologie statistique / Statistical biology
Texte intégral
Responsable : Olivier Rivoire
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1Notre équipe cherche à comprendre les principes sous-jacents aux capacités d’adaptation des systèmes biologiques. Notre approche est inspirée de la physique statistique et combine des analyses de séquences génomiques, des expériences quantitatives in vitro et des modèles mathématiques. Nos projets actuels sont organisés autour de trois systèmes modèles: les anticorps, les protéases et les génomes bactériens.
2Nos résultats récents comprennent le développement de méthodes statistiques pour étudier la co-évolution dans les séquences de protéines et de génomes, le développement d’expériences d’évolution d’anticorps par la méthode de phage display et le développement de modèles mathématiques d’évolution de populations sujettes à des environnements fluctuants.
Publications
3Rivoire O., « Informations in models of evolutionary dynamics », J. Stat. Phys., vol. 162, 2016, p. 1324-1352, DOI : 10.1007/s10955-015-1381-z.
Boyer S., Biswas D., Kumar Soshee A., Scaramozzino N., Nizak C. et Rivoire O., « Hierarchy and extremes in selections from pools of randomized proteins », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 113, no 13, 2016, p. 34823487, DOI : 10.1073/pnas.1517813113.
Junier I. et Rivoire O., « Conserved units of co-expression in bacterial genomes: An evolutionary insight into transcriptional regulation », PloS One, 2016, vol. 11, no 5, e0155740, DOI : 10.1371/journal.pone.0155740.
Rivoire O., Reynolds K.A. et Ranganathan R., « Evolution-based functional decomposition of proteins », PLoS computational biology, vol. 12, no 6, 2016, e1004817, DOI : 10.1371/journal.pcbi.1004817.
Mayer A., Mora T., Rivoire O. et Walczak A.M., « Diversity of immune strategies explained by adaptation to pathogen statistics », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 113, no 31, 2016, p. 86308635, DOI : 10.1073/pnas.1600663113.
Pour citer cet article
Référence papier
Olivier Rivoire, « Biologie statistique / Statistical biology », L’annuaire du Collège de France, 117 | 2019, 638.
Référence électronique
Olivier Rivoire, « Biologie statistique / Statistical biology », L’annuaire du Collège de France [En ligne], 117 | 2019, mis en ligne le 04 juin 2020, consulté le 07 août 2022. URL : http://journals.openedition.org/annuaire-cdf/14761 ; DOI : https://doi.org/10.4000/annuaire-cdf.14761
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