1La reconversion des anciennes archives départementales en établissement d’enseignement supérieur a fourni l’occasion de diagnostiquer les bâtiments du couvent des Carmes déchaussés qu’elles occupaient depuis 1911. Situé sur un balcon du versant nord de la colline de Fourvière, dominant la Saône de près de 50 m, le site est occupé dès l’époque antique. La fouille de l’emprise de la fondation d’une grue de chantier a fortuitement mis au jour la façade d’un bâtiment fondée perpendiculairement à la pente, dans les sables argileux gris-vert et les limons partiellement grésifiés du Miocène qui nappent le socle rocheux. Les restes d’un mur de refend sont aboutés à sa face interne. Aucun sol associé n’a été conservé. Le mur est amputé de ses extrémités par deux grandes fosses, comblées par le produit de la démolition d’un habitat des ii^e-iii^e s. L’un de ses comblements sert de radier de fondation à un petit massif de maçonnerie arasé à 208,57 m NGF, et prolongé au xiv^e s. par un modeste aménagement de jardin en pierres sèches – seul vestige découvert des maisons médiévales connues grâce aux archives. Une brèche dans le mur d’une cave située à plus de 30 m de là, laisse encore apercevoir plusieurs maçonneries antiques en élévation, culminant à 210,74 m. L’espace intermédiaire est occupé par un épais matelas de limon argilo-caillouteux colluvionné, particulièrement compact et cohésif, dans lequel ont été fondés tous les bâtiments ultérieurs.

2Le couvent des Carmes est fondé en 1617 par Philibert de Nérestang, grand maître des ordres de Notre-Dame et Saint-Lazare, sur le domaine rural de Thunes, apparu 250 ans plus tôt dans la documentation. Deux maisons occupent alors le domaine. La maison du Petit Thunes, dont une partie de la façade septentrionale a été mise au jour au cours du diagnostic et qui est figurée sur le grand plan scénographique, a sans doute été construite au début du xvi^e s., par Pierre Garbot, membre important de la chancellerie royale. La maison du Grand Thunes, plus récente (fin xvi^e-début xvii^e s.), est probablement l’œuvre des Scarron, une famille de notables lyonnais auxquels le domaine est finalement racheté. C’est dans cette seconde maison que les Carmes s’installent et aménagent une chapelle provisoire en 1618. La construction de l’église Notre-Dame du Montcarmel, débutée en 1623, est rapidement interrompue : il faut reloger les moines ailleurs que dans la maison du Grand Thunes, à laquelle il a été prévu de greffer la nef, et qui devait elle-même accueillir un chœur à deux niveaux. Un premier dortoir, avec réfectoire en rez-de-chaussée, est construit en 1625 contre la façade septentrionale du Petit Thunes, perpendiculairement au noviciat abouté quelques années plus tôt au pignon ouest de la même maison. L’espace séparant les deux maisons de Thunes est transformé en cloître. L’église est finalement consacrée en 1640, mais ne fut achevée qu’après 1666. En 1650, les Carmes entreprennent la construction d’un grand corps de logis s’étendant de la façade de l’église au cloître. Il comprend plusieurs espaces fonctionnels au rez-de-chaussée (sacristie, chambre des pèlerins, parloir, salle capitulaire, etc.) et un vaste dortoir cloisonné à l’étage. En 1663, l’ancien noviciat est transformé pour accueillir de nouvelles cuisines, un chauffoir, une infirmerie et une chapelle. L’ensemble est distribué par un escalier à quatre noyaux construit dans l’ancienne maison du Petit Thunes rehaussée à cet effet. Dans l’étage ajouté au cours de la même campagne à la maison du Grand Thunes, on aménage une bibliothèque. En 1684, un dernier corps de logis est construit sur le côté sud du cloître, le long du chemin de Montauban. Il abrite deux niveaux de dortoirs au-dessous d’une roberie.