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Résumés des journées 2023

Enjeux et apports des analyses paléomicrobiologiques invasives pour l’étude des infections des populations corses anciennes

Challenges and contributions of invasive paleomicrobiological analyses for the study of infections in ancient Corsican populations
Philippe Biagini, Jean-Pierre Poli, Elodie Guinoiseau, Avril Meffray, Yann Ardagna, Catherine Rigeade, Denis Jouffroy, Angélique Nonza-Micaelli, Antonia Colonna et Jacques Chiaroni

Texte intégral

1Les recherches bioarchéologiques portant sur la santé des populations corses à travers le temps sont encore totalement inédites. Cet aspect des interactions homme-milieux n’a en effet été que très peu exploité dans le cadre des recherches archéologiques menées depuis plus de 20 ans en Corse. Des collections ostéoarchéologiques récentes sont actuellement disponibles pour études, notamment dans le cadre de recherches anthropobiologiques dépassant l’établissement du profil biologique des sujets exhumés. Des investigations paléoépidémiologiques, via des approches combinées en paléopathologie macroscopique et en paléomicrobiologie, couplées à des recherches archivistiques, sont ainsi susceptibles d’apporter des données d’une grande richesse sur les modes de vie insulaires et sur les dynamiques épidémiques anciennes. C’est dans ce contexte que le projet collaboratif "Paléomicrobiologie des populations corses anciennes" a été développé, reposant sur une synergie entre spécialistes de plusieurs entités des Universités de Corse et d’Aix-Marseille ainsi que de l’Inrap, en interaction avec la DRAC Corse. L’objectif est d’explorer les pathologies infectieuses spécifiques qui ont pu être présentes au cours des siècles sur ce territoire, pathologies zoonotiques, endémiques et épidémiques, de même que les infections chroniques qui ont pu être transmises par contacts fréquents avec le reste des populations méditerranéennes. Les protocoles moléculaires mis en œuvre à partir de restes dentaires et osseux combinent approches séquence-dépendantes (amplifications géniques par réaction en chaîne par polymérase) ciblant un pathogène donné et approches "en aveugle", séquence-indépendantes (séquençage massif de nouvelle génération), avec analyses bioinformatiques (reconstruction génomique, positionnement taxonomique/phylogénie) des séquences obtenues. Ces approches paléoépidémiologiques, intégratives, sont enrichies de données pluridisciplinaires, dépassant le strict cadre de l’archéologie et de l’anthropologie biologique, avec intégration de données historiques/archivistiques et apport de disciplines connexes en sciences humaines et sociales. Des exemples ciblés provenant des séries ostéoarchéologiques étudiées sont ici présentés afin d’illustrer l’intérêt et les problématiques de ces approches moléculaires.

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Pour citer cet article

Référence électronique

Philippe Biagini, Jean-Pierre Poli, Elodie Guinoiseau, Avril Meffray, Yann Ardagna, Catherine Rigeade, Denis Jouffroy, Angélique Nonza-Micaelli, Antonia Colonna et Jacques Chiaroni, « Enjeux et apports des analyses paléomicrobiologiques invasives pour l’étude des infections des populations corses anciennes »Bulletins et mémoires de la Société d’Anthropologie de Paris [En ligne], 35(S) | 2023, mis en ligne le 14 janvier 2023, consulté le 28 janvier 2023. URL : http://journals.openedition.org/bmsap/10759 ; DOI : https://doi.org/10.4000/bmsap.10759

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Auteurs

Philippe Biagini

UMR 7268 ADES, Aix Marseille Université, CNRS, EFS, Marseille, France
philippe.biagini[at]univ-amu.fr

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Jean-Pierre Poli

UMR 6134 SPE, Université de Corse, CNRS, Corte, France ; FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France

Elodie Guinoiseau

UMR 6134 SPE, Université de Corse, CNRS, Corte, France ; FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France

Avril Meffray

UMR 6134 SPE, Université de Corse, CNRS, Corte, France ; FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France

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Yann Ardagna

UMR 7268 ADES, Aix Marseille Université, CNRS, EFS, Marseille, France

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UMR 7268 ADES, Aix Marseille Université, CNRS, EFS, Marseille, France ; Inrap, Centre de Recherches Archéologiques, Marseille, France

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Denis Jouffroy

FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France ; UMR 6240 LISA, Université de Corse/CNRS, Corte, France

Angélique Nonza-Micaelli

FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France ; UMR 6240 LISA, Université de Corse/CNRS, Corte, France

Antonia Colonna

FRES 3041, Fédération de Recherche Environnement et Société, Corte, France ; UMR 6240 LISA, Université de Corse/CNRS, Corte, France

Jacques Chiaroni

UMR 7268 ADES, Aix Marseille Université, CNRS, EFS, Marseille, France

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